betaín možno použiť ako kŕmnu prísadu na zlepšenie zdravia čriev. Nepriaznivé faktory, ako je tepelný stres, môžu u zvierat viesť k zlej elasticite čriev. Keď teplota okolia stúpne, krv bude prednostne prúdiť do pokožky, aby sa uľahčil odvod tepla. To vedie k zníženiu prietoku krvi do gastrointestinálneho traktu, čo následne ovplyvňuje trávenie a znižuje stráviteľnosť živín.
Stres môže spôsobiť zmeny v črevnej štruktúre rastúcich ošípaných, ak neexistuje žiadna ďalšia kontrola, zníži funkciu čriev. Betaín má priaznivé účinky na črevnú štruktúru a imunitný systém zvierat. Svojím priaznivým vplyvom na udržanie celistvosti črevného traktu zvieraťa môže chrániť zviera pred dehydratáciou spôsobenou kokcidiózou alebo premnožením iných nežiaducich mikroorganizmov v črevnom trakte.
Výskum ukazuje, že zmiešané použitie betaínových a ionofórových antikokcidiálnych liekov môže výrazne znížiť riziko infekcie kokcídiami u zvierat a následne zlepšiť ich rastovú funkciu a odolnosť. Najmä u prasiatok môže pridanie betaínu do krmiva zlepšiť funkciu čriev a zabrániť hnačke a zvýšiť príjem krmiva, čo má vynikajúcu praktickú hodnotu. Okrem toho pridanie betaínu do krmiva môže zmierniť stresovú reakciu prasiatok a potom zlepšiť príjem krmiva a rýchlosť rastu odstavených prasiatok.